針對聯合報報導及部分環保團體對於環境部彭部長在環評大會上發言的質疑，指稱部長角色混亂、淪為開發單位附屬等疑慮，環境部強調，彭部長為環評審查委員會主任委員，主持會議秉持公正客觀立場，維護環評委員獨立專業審查，於主持會議期間並無對沙崙生態科學園區生態保育協作平台發言，係於會後記者詢問才予以說明，環境部特此發布新聞稿，還原部長發言原意並進行澄清說明。 沙崙開發案是一個高度複雜且敏感的公共治理課題，不僅涉及單一開發案的審查，更關乎國家科技發展、區域經濟布局與生態棲地保全之間的平衡考驗。面對此案，環境部始終秉持「正視衝突、制度承擔」的態度，在聽聞開發案之初，便主動建議建立事前溝通協作討論的平台，期盼讓開發單位與生態鳥類社群展開對話與討論。 外界對彭部長會後發言的誤解，環境部提出以下4點澄清： 第一，沙崙生態科學園區生態保育協作平台為「跨部會溝通與協調介面」，絕非開發單位之下的附屬機制。本案涉及台86線到二仁溪一帶完整的生態廊道與棲地系統，政府必須以更高的行政層級來面對國家在生態保育與經濟發展間整體調節的制度課題，而非將其簡化為單一開發案。因此，環境部絕非國科會底下的附屬單位。 第二，成立協作平台的目的是建立環評前環境永續社會溝通的新治理模式，絕非替任何一方背書。部長指稱「不是開發單位可獨自承擔的壓力」，是因為本案涉及受威脅物種與重要棲地，政府鼓勵透過平台邀請生態與環境團體、專家學者共同參與，在公開、透明、科學的基礎上持續對話並共同尋求解方。參與平台絕對不等於替開發案背書，政府會保護這個對話空間，讓各方能在不被貼標籤的情況下提出專業意見。 第三，環境部正視區外補償的制度困境，將協助釐清權責以確保實質達成「生物多樣性淨無損失(NNL)」。針對環團擔憂區外補償流於形式的問題，環境部承諾會與相關部會共同協調，尋求具備實質維管能力的主責單位，確保有清楚的土地、經費、監測指標與長期維護機制，絕不讓補償措施停留在書面規劃。 第四，二階環評是啟動更深入社會對話的開始，而不是結論。進入二階環評代表本案將進行更深入、更完整的審查，並不代表爭議已經結束。在區外生態規劃尚未具體定案之前，環境部完全尊重參與平台的團體採取審慎觀察的立場。 環境部最後強調，環境部為環評審查主管機關，並無加入協作平台運作，但會持續觀察後續發展，期待環評事前協作能成為爭議案件之通例。面對敏感複雜的環評案，環境部的核心角色，是確保環境價值被嚴肅看待、確保程序公開透明、確保科學資料被充分討論，並盡可能尋找開發與保育之間非零和對立的負責任公共選擇。建立一套具備韌性、能依據科學與社會意見不斷修正且被社會信任的治理模式，是環境部持續努力的目標。
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